AFLP and SRAP markers linked to the mj gene for root-knot nematode resistance in cucumber
Devran, ZübeyirFikret Firat, AhmetTör, MahmutMutlu, NedimHalil Elekçiolu, Ibrahim
Nematóides causadores de galhas (Meloidogyne spp.) em raízes de pepino Cucumis sativus L.) são de ocorrência mundial. Marcadores moleculares ligados ao gene mj que confere resistência a M. javanica em pepino podem auxiliar na seleção de plantas em programas de melhoramento genético. Cem AFLP (EcoRI-MseI) e 112 SRAP foram usados para a seleção de parentais resistentes e susceptíveis, por meio de polimorfismos, para o desenvolvimento de marcadores moleculares ligados ao gene mj. Entre 100 oligonucleotídeos iniciadores para AFLP, 92 geraram fragmentos amplificados de DNA e dois produziram candidatos a marcadores (E-ATT/M-CAA e E-AAC/M-CTG). Os dois fragmentos amplificados foram clonados e seqüenciados. Oligonucleotídeos iniciadores sintetizados a partir das seqüências de nucleotídeos obtidas não produziram fragmentos polimórficos entre os parentais. Além disso, as seqüências de nucleotídeos não contêm sítios de restrições ou deleções que possam ser convertidos em marcadores CAPS ou SCAR. As duas seqüências de nucleotídeos obtidas para os marcadores polimórficos AFLP foram usadas primeiramente para sintetizar os oligonucleotídeos iniciadores específicos D1F, D1R, D17F e D17R. Oligonucleotídeos iniciadores senso e antisenso para SRAP foram usados em combinações com os quatro oligonucleotídeos iniciadores específicos para identificação de polimorfismos entre os parentais. Dentre 112 combinações testadas, 11 geraram polimorfismos entre indivíduos parentais. O programa MapMaker Exp 3.0 foi usado para análise desses 11 marcadores. Foram identificados dois marcadores inseridos no gene mj nas distancias de 16.3 e 19.3 cM. Os resultados indicam que esses marcadores podem ser usados para o desenvolvimento de marcadores moleculares para o gene mj.
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