Efeitos da variação da ploidia na expressão diferencial de genes em feijão-caupi
Qiu, XuewenKuang, HuiyunZeng, ChuntaoLi, DanYang, YouxinGan, YudiFan, ShuyingWu, Caijun
O objetivo deste estudo foi investigar as diferenças nos perfis de expressão gênica de diplóides e autotetraplóides em feijão-caupi e fornecer base teórica para a triagem de genes-chave de expressão diferencial e melhoramento de ploidia. Os fenótipos e teores de clorofila, açúcar solúvel e proteína solúvel de diplóides e autotetraplóides de feijão-caupi foram comparados e o sequenciamento do transcriptoma foi realizado. As folhas autotetraploides do feijão-caupi apresentaram-se mais espessas e de cor verde mais escura que as folhas diplóides, e os teores de clorofila, açúcar solúvel e proteína solúvel nas folhas foram maiores. Um total de 2678 genes diferencialmente expressos (DEG) foram analisados no diplóide e autotetraploide do feijão-caupi. Entre eles, havia 421 genes com maior expressão de tetraploide do que diplóides, e 2257 genes com menor expressão de tetraploide do que diplóides. Todos os 2678 DEGs foram anotados na biblioteca funcional GO. Os DEGs foram concentrados principalmente no metabolismo e na composição celular. A análise da via KEGG mostrou que o diplóides e o autotetraplóide do feijão-caupi apresentam diferenças significativas na biossíntese de flavonoides, degradação de outros glicanos, biossíntese de fenilpropano, metabolismo da sacarose do amido, biossíntese de queratina, âmbar e cera, ritmo circadiano e vias vegetais.
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