Acurácia de predição genômica em feijoeiro-comum via modelos Bayesianos

Barili, Leiri DaianeVale, Naine Martins doSilva, Fabyano Fonseca eCarneiro, José Eustáquio de SouzaOliveira, Hinayah Rojas deVianello, Rosana PereiraValdisser, Paula Arielle Mendes RibeiroNascimento, Moyses

Objetivou-se incorporar informações genômicas de marcadores SNP (single nucleotide polymorphism) na avaliação genética das características stay-green (SG), arquitetura de planta (AP), aspecto de grãos (AG) e produtividade de grãos (PG) em feijoeiro-comum via modelos Bayesianos. Estes modelos foram comparados quanto a acurácia de predição e habilidade de estimação da herdabilidade para cada característica. Utilizaram-se informações de 80 cultivares genotipadas para 377 marcadores SNP, cujos efeitos de substituição alélica foram estimados por meio de cinco diferentes modelos Bayesianos: Bayes A (BA), B (BB), C (BC), LASSO (BL) e regressão ridge (BRR). Embora as acurácias de predição calculadas por meio de análise de validação cruzada tenham sido similares dentro de cada característica, o modelo BB se destacou para a característica SG, enquanto o modelo BRR foi indicado para as demais. As herdabilidades estimadas para SG, AP, AG e PG foram, respectivamente, 0,61, 0,28, 0,32 e 0,29. Em resumo, os métodos contemplados mostraram-se efetivos e de fácil implementação. O conjunto de marcadores utilizado pode auxiliar na seleção precoce de genótipos promissores, uma vez que a incorporação de informações genômicas aumenta a acurácia de predição do mérito genético estimado.(AU)

1. cross-validation
2. SNP markers
3. Phaseolus vulgaris
4. validação cruzada
5. marcadores SNP