Bacterial diversity characterization in petroleum samples from Brazilian reservoirs
Maia de Oliveira, ValériaDurães Sette, LaraChristina Marques Simioni, KarenVaz dos Santos Neto, Eugênio
Este estudo teve como objetivo comparar as comunidades bacterianas de amostras de água de formação e de óleo de reservatórios de petróleo brasileiros com diferentes graus de biodegradação usando a técnica de PCR-DGGE. O DNA ambiental foi isolado e empregado em reações de PCR com primers bacterianos, com subseqüente separação dos fragmentos de DNAr 16S em DGGE. Os produtos de PCR foram também clonados e seqüenciados, visando à afiliação taxonômica dos membros da comunidade. Os fingerprints obtidos permitiram a comparação direta entre as comunidades bacterianas das amostras de óleo com diferentes graus de biodegradação, assim como entre as comunidades da água de formação e do óleo do reservatório não biodegradado. Perfis de DGGE muito similares foram observados para todas as amostras, e a diversidade dos filotipos bacterianos predominantes mostrou-se baixa. Os resultados de clonagem e seqüenciamento revelaram diferenças mais significativas entre as amostras de água de formação e de óleo do reservatório não biodegradado. Bacillus sp. e Halanaerobium sp. mostraram-se os componentes predominantes da comunidade bacteriana da presente na amostra de água de formação, ao passo que a amostra de óleo incluiu também Alicyclobacillus acidoterrestris, Rhodococcus sp., Streptomyces sp. e Acidithiobacillus ferrooxidans. A técnica de PCR-DGGE, combinada com clonagem e seqüenciamento dos produtos de PCR, revelou a presença de grupos taxonômicos não encontrados anteriormente nestas amostras quando métodos baseados em cultivo e na construção de bibliotecas de genes RNAr 16S foram utilizados, evidenciando a necessidade de um estudo polifásico a fim de contribuir para o conhecimento da diversidade microbiana em ambientes extremos como reservatórios de petróleo.
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